Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem3Q9JKE1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms