Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnbip1Q9JJN6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms