Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1fQ9JIS7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms