Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms