Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms