Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms