Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnft1Q9DCN7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnft1Q9DCN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms