Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3fQ9DCH4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms