Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MNCb-2875Q9DCB3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MNCb-2875Q9DCB3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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MNCb-2875Q9DCB3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MNCb-2875Q9DCB3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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