Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apbb2Q9DBR4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apbb2Q9DBR4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms