Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fundc1Q9DB70 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms