Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms