Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtm2bQ9DAC0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms