Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd9Q9D9M4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd9Q9D9M4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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