Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D8N1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms