Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chmp5Q9D7S9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms