Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 441.6 ms