Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snf8Q9CZ28 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snf8Q9CZ28 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snf8Q9CZ28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snf8Q9CZ28 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snf8Q9CZ28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snf8Q9CZ28 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snf8Q9CZ28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snf8Q9CZ28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms