Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms