Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms