Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms