Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl20Q9CQL4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl20Q9CQL4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms