Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer1Q9CQL2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer1Q9CQL2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms