Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQF4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms