Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5aQ9CQD1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms