Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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