Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a6dQ99N07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms