Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RtcbQ99LF4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RtcbQ99LF4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms