Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin3Q99JB8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms