Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ripply3Q924S9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms