Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim7Q923T7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim7Q923T7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim7Q923T7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim7Q923T7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim7Q923T7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim7Q923T7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim7Q923T7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim7Q923T7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim7Q923T7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms