Protein–RNA interactions for Protein: Q923J1

Trpm7, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm7Q923J1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpm7Q923J1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpm7Q923J1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms