Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Itm2cQ91VK4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms