Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
0610009B22RikQ8R3W2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
0610009B22RikQ8R3W2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms