Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc58Q8R3Q6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms