Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbm48Q8K2X2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm48Q8K2X2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.4 ms