Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sde2Q8K1J5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms