Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FgbQ8K0E8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgbQ8K0E8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms