Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZM8

Muc4, Mucin-4, mousemouse

Predictions only

Length 3,443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc4Q8JZM8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Muc4Q8JZM8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Muc4Q8JZM8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms