Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms