Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RybpQ8CCI5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms