Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms