Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwc2Q8C8N3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms