Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoa5Q8C7G5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoa5Q8C7G5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa5Q8C7G5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms