Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Iffo1Q8BXL9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Iffo1Q8BXL9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms