Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx1bQ8BX32 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms