Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan12Q8BKT6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan12Q8BKT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms