Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot10Q8BH15 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot10Q8BH15 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms