Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms