Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdp1Q7TSG2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms